ندد وزير الخارجية الإيراني محمد جواد ظريف، باغتيال العالم النووي محسن فخري زاده، وكتب على حسابه على تويتر "هناك مؤشرات قوية على تورط إسرائيل"، ووصفها بأنها "عمل جبان". كما دعا ظريف المجتمع الدولي إلى إدانة ما أسماه "عمل إرهابي ترعاه دولة".
ونقل التلفزيون عن رئيس أركان الجيش الإيراني، الجنرال محمد حسين باقري، تطرقه إلى اغتيال العالم النووي محسن فخري زاده ، قائلا إن الرد سيكون قاسيا. واضاف باقري:" نعد بعدم التوقف حتى نعاقب المسؤولين عن الاغتيال. عمل الشهيد فخري زاده سيستمر الى الابد".
